基本信息

职称：副教授

邮箱：cyf176@hnu.edu.cn

地址：湖南省长沙市韶山南路498号中南林业科技大学计算机与数学学院（求是楼1514室）

个人简介

陈一凡，副教授，硕士生导师，湖南大学计算机科学与技术专业博士。主要致力于AI4Science、生物医药大模型与分子设计智能体等前沿交叉领域研究。近年来，在领域权威期刊与会议发表学术论文30余篇，其中一作/通讯作者近20篇，一作单篇最高被引近200次，授权国家发明专利1项。现主持国家自然科学基金等省部级以上项目3项，并作为核心骨干参与多项国家及省市级课题。

学习经历

2017年9月-2023年6月，湖南大学，计算机科学与技术，博士

2012年9月-2015年6月，湖南大学，计算机技术，硕士

任职情况

2025年12月-至今，中南林业科技大学计算机与数学学院，副教授

2023年9月-2025年11月，中南林业科技大学计算机与数学学院，讲师

2015年9月-2017年7月，湖南工学院，计算机科学与工程学院，教师

2011年7月-2012年8月，湖南省联通株洲分公司，工程师

主要研究方向

AI4Science、生物医药大模型、分子设计智能体。

科研情况

(1) 国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目（C类）[原青年科学基金项目], 62402533, 基于渐进式多模态和分子模拟的PROTAC连接体设计新策略研究, 2025-01-01 至 2027-12-31, 在研, 主持

(2) 湖南省自然科学基金，青年项目，2025JJ60400，可解释多模态驱动的PROTAC 分子智能设计与优化研究，2025-01至2027-12，在研，主持

(3) 湖南省教育厅, 优秀青年项目, 23B0237, 基于深度生成模型的PROTAC设计新策略研究, 2024-01 至2026-12, 在研, 主持

(4) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 62172158, 非小细胞肺癌相关的lncRNA生物标志物及其药物扰动预测研究, 2022-01-01 至 2025-12-31, 结题, 参与

(5) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 61976086, 自动驾驶系统的CPS计算架构与视觉感知方法研究, 2020-01-01 至 2023-12-31, 结题, 参与

(6) 国家自然科学基金委员会, 面上项目, 61876060, 工业互联网中软件定义的智能化边缘计算系统, 2019-01-01 至 2022-12-31, 结题, 参与

(7) 湖南省自然科学基金，面上项目，2020JJ4220，面向高维搜索空间的超多目标进化优化算法及其应用研究, 2020-01-01 至 2021-12-31, 结题, 参与

(8) 长沙市自然科学基金, 面上项目, kq20140582014058, 面向可解释性深度网络表示的蛋白质 RNA 结合位点预测研究, 2020-07 至 2022-06, 结题, 参与

代表性学术成果

[1] Kun Yang#, Yifan Chen#, Yanshi Wei, Mingrong Xiang, Linlin Zhuo, Xiangzheng Fu, Dongsheng Cao, Wenqian Zhang. MicroEnvPPI: Microenvironment-Aware Optimization Enables Generalizable Protein-Protein Interaction Prediction[J]. Journal of Chemical Information and Modeling, 2025. (JCR 1区)

[2] Xiangzheng Fu, Li peng, Haowen Chen, Mingqiang Rong, Yifan Chen*, Dongsheng Cao, Sisi Yuan and Aiping Lu, GRAPE: Graph-Regularized Protein Language Modeling Unlocks TCR-Epitope Binding Specificity[J]. Briefings in Bioinformatics, 2025. (JCR 1区)

[3] Zongyi Yang, Kaiqin Li, Li Peng, Yifan Chen* and Wei Liang. Universal Bioactive Peptide Recognition via Local-Aware Adaptive Global Sparse Attention, IEEE BIBM 2025 (CCF B)

[4] Qingquan Liao, Xuchong Liu, Wei Zhao, Yu Tong, Fangzheng Xu, Xinxin Liu, Yifan Chen*. IRGL-RRI: interpretable graph representation learning for plant RNA–RNA interaction discovery[J]. Frontiers in Plant Science, 2025.(JCR 1区)

[5] Zihao Yang, Huaping Li, Li Peng, Yifan Chen*. CircRNA-Drug Sensitivity Prediction Method Based on the Integration of Sparse Attention and Fourier-KAN, IEEE BIBM 2025 (CCF B)

[6] Zhen Li, Mingming Qi, Juyuan Huang, Wei Zhang, Xu Tan, Yifan Chen*. Geometry-enhanced graph neural networks accelerate circRNA therapeutic target discovery[J]. Frontiers in Genetics, 2025.(JCR 2区)

[7] Yifan Chen, Zhenya Du, Xuanbai Ren, Chu Pan, Yangbin Zhu∗, Zhen Li, Tao Meng, Xiaojun Yao∗. mRNA-CLA: An interpretable deep learning approach for predicting mRNA subcellular localization[J]. Methods, 2024. (JCR 1区)

[8] Li Peng, Wang Wang, Wenhui Xiao, Xiangzheng Fu, Yifan Chen*. Dual-Stream Heterogeneous Graph Neural Network Based on Zero-Shot Embeddings for Predicting miRNA-Drug Sensitivity, IEEE BIBM 2024 (CCF B)

[9] Lei Xu, Xiangzheng Fu, Linlin Zhuo, Zhecheng Zhou, Xuefeng Liao, Sha Tian, Ruofei Kang, Yifan Chen* SGAE-MDA: Exploring the MiRNA-disease associations in herbal medicines based on semi-supervised graph autoencoder. Methods, 2024. (JCR 1区)

[10] Yifan Chen, Shaomiao Chen, Kuan-Ching Li, et al. DRJOA: intelligent resource management optimization through deep reinforcement learning approach in edge computing[J]. Cluster Computing, 2023. (JCR 1区)

[11] Xiangzheng Fu, Yifan Chen*, and Sha Tian. DlncRNALoc: A discrete wavelet transform-based model for predicting lncRNA subcellular localization. Mathematical Biosciences and Engineering, 2023.

[12] Yifan Chen, Zejun Li, Zhiyong Li. Prediction of Plant Resistance Proteins Based on Pairwise Energy Content and Stacking Framework[J]. Frontiers in Plant Science, 2022. (JCR 1区)

[13] Linlin Zhuo, Yifan Chen*, Bosheng Song, et al. A model for predicting ncRNA–protein interactions based on graph neural networks and community detection[J]. Methods, 2022. (JCR 1区)

[14] Yifan Chen, Xiangzheng Fu, Zejun Li, et al. Prediction of lncRNA-protein interactions via the multiple information integration[J]. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2021. (JCR 1区)

[15] Yifan Chen, Zhiyong Li, Bo Yang, Ke Nai, Keqin Li. A Stackelberg game approach to multiple resources allocation and pricing in mobile edge computing[J]. Future Generation Computer Systems, 2020. (JCR 1区)